GOLD 一個計算大分子與小分子結合模式的分子對接程序

GOLD是一個計算大分子與小分子結合模式的分子對接程序，是Sheffield大學，laxoSmithKline公司和CCDC協作的產物。因其準確性和可靠性在分 子模擬圈內評價很高。GOLD的遺傳算法最適合虛擬篩選和并行計算。目前發布的版本可在商業的PC GRID系統上使用。它采用遺傳算法（GA）進行蛋 白-配體對接；對接時配體完全柔性和蛋白部分柔性；能量函數部分依賴于來自CSD數據庫的構象和非鍵接觸；打分函數有GoldScore、ChemScore和用 戶自己定義的打分函數；多種限制選項；對接結果后處理工具：SILVER；自動考慮活性口袋內結合的水分子；改進的處理金屬配位結構方法；對特 別的配體自動衍生GA設置。